Если кошки не всегда разделяются на дневное время, и бывают случаи, когда они остаются вместе, то может и не надо их разделять... быстрее договорятся. Ну а вообще, конечно, нужно исходить из того, как часто происходят стычки, какой они носят характер. Если всё исчерпывается случаями, которые вы описали, я бы рискнула оставлять вместе (с подстриженными когтями, конечно).
Из того, что кош не игривая, не следует, что ей комплекс не нужен - на полочках можно удобно лежать и наблюдать за окружающими. Лазалку я бы поставила большую, с несколькими высокими полками, так чтобы с одной стороны кошки друг другу не мешали, но с другой стороны были бы поблизости, а ту, которая есть перенесла бы в другую комнату. А то что у старшей есть своя нычка, куда куночка не забирается - очень хорошо.

кажется, младшая начала подрастать и входить в силу Она уже довольно угрожающе уукает на старшую. Старшая теперь озирается, когда входит в помещение.

и чем все кончилось?

Все хорошо кончилось, куночек теперь аж две, и детки кунячьи, а та которая голубой обижалась теперь сама всех строит))))

у меня кун-мальчик тоже о втором думаю и боюсь как они одни дома будут не подерет ли мой годовалый кот мелкого

сложный вопрос, у меня их 9 и как понимаете не в один миг они все появились, разница между старшим и младшей почти 4 года. Я старалась что бы все приезжали на выходные или на отпуск, что бы все знакомства были на моих глазах, кому то хватало 2-х дней, а кому то побольше.но вот подраных шкурок у нас не было, могут старшие младших погонять так сказать что бы знали кто в доме хозяин, но меня слушаются беспрекословно и при мне никогда не затеют разборки.

Прошло уже больше двух лет со времени начала этой темы Куниц у меня теперь две, а старшая стерилизованная русская голубая стала очень заботливой тетушкой для маленьких кунят, которых родили мои большие медведицы